28日下午,曾国藩赶到南京,几小时后便亲自审讯李秀成。老谋深算的他对李秀成施展了攻心战。曾国藩的攻心策略果然收到了效果,李秀成自愿书写供词。李秀成从7月30日开始动笔,历时9天,在囚笼中亲笔写下数万字的供词。与此前此后的表现判若两人的是,李秀成在供词中明显流露出乞降求抚之意。他对曾国藩和清王朝大加谀颂,说"早就听说曾中堂恩深量广,有拯救世人之心",表示"我见老中堂大义恩深,心悔莫及",将天京沦陷喻作"我主无谋,清朝有福"。他自愿以"罪将"之身,出面代为招降太平军余部,从而"尽义对大清皇上,免大清心腹之患再生"。
可怜李秀成终究还是被曾国藩算计了。此时的曾国藩心里清楚,一旦献俘到京城,他们兄弟二人欺瞒朝廷的一些事情,如曾国荃洗劫天京中饱私囊的真相等,便都会曝光,难免会落个欺君之罪。无论从哪个方面考虑,他都不能留下李秀成这个活口。8月3日晚,曾国藩垂询赵烈文的意见,表示打算不等朝廷降旨,便将李秀成从速"正法"。赵烈文回答说:"中堂已经录有供词,没什么不妥的,而且此贼非常狡猾,不宜把他押解进京。"两人不谋而合。
8月7日,仍在赶写供词的李秀成写下了"昨夜承老中堂叫至驾前讯问,施以恩惠,无以为报"等语。结果墨迹未干,曾国藩就派李鸿裔向李秀成摊牌,表示"国法难逃,不能开脱",并于当天傍晚将李秀成处死。